德孚医药出版社在国际慢阻肺病期刊发表了最新文章基于免疫浸润分析的慢性阻塞性肺病关键免疫相关基因的鉴定。
内容摘要?目的:慢性阻塞性肺病(COPD)是全世界死亡和发病的一个主要原因。我们需要更好地了解慢性阻塞性肺病患者的新生物标志物及其在慢性阻塞性肺病进展过程中的复杂机制。
?方法:进行了一种算法,揭示了COPD样本中22个免疫细胞亚群的比例。根据GSE数据集的差异表达基因(DEGs)获得差异表达的免疫相关基因(DE-IRGs),并从ImmPort数据库下载了个免疫相关基因(IRGs)。通过基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)路径分析和IngenuityPathway分析(IPA)对DE-IRGs进行功能富集分析。我们将与免疫细胞有关联的DE-IRG定义为枢纽基因。通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络探讨了中心基因之间的潜在相互作用。
?结果:CIBERSORT结果显示,COPD患者的肺组织比正常样本含有更多的静止NK细胞、活化树突状细胞和中性粒细胞。然而,滤泡辅助T细胞和静止树突状细胞的比例相对较低。获得了38个DE-IRG用于进一步分析。功能富集分析显示,这些DE-IRG在几个免疫相关的生物过程和途径中明显富集。值得注意的是,我们还观察到DE-IRG与冠状病*疾病COVID-19在COPD进展中的关系。经过相关分析,六个与免疫细胞相关的DE-IRG被认为是枢纽基因,包括AHNAK、SLIT2TNFRRSF10C、CXCR1、CXCR2和FCGR3B。
?结论:在本研究中,我们研究了免疫相关基因作为新的诊断生物标志物,并基于CIBERSORT分析探讨了COPD的潜在机制,为COPD治疗提供了新的认识。
?关键词:慢性阻塞性肺病;COPD;免疫相关基因;IRGs;CIBERSORT;诊断
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